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在一定的环境条件下，微生物通过代谢活动对饲料原料中的某些物质进行分解和转化，使原料中不易被牲畜和家禽利用的大分子物质转变成为易于消化吸收的小分子物质，同时，微生物得到增殖，由于微生物菌体的单细胞蛋白含量很高，因而提高了成品饲料的蛋白质含量，这就是广义的微生物蛋白饲料。另外若微生物菌种群中含有对牲畜和家禽具有益生功能的饲用微生物，则微生物蛋白饲料就会具有更好的饲喂效果。
微生物易于变异，可通过各种物理、化学方法进行诱变，或采用基因重组技术对单细胞蛋白菌种进行遗传性状的改变，从而较易获得高产的突变株。
植物蛋白来源广泛、供应稳定，价格远远低于动物蛋白和鱼粉，是良好鱼粉替代物。但由于其中抗营养因子的存在和氨基酸不平衡等因素，使得养殖对象的生理功能、肉质组分及生长率都会或多或少的受到影响。
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